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  • 姓名:朱晓

  • 职称:讲师

  • 所在院系:计算机科学与技术系

  • 最后学位:博士

  • 最后学历:研究生

  • 最后毕业院校:哈尔滨工业大学

  • 所学专业:计算机应用技术

  • 研究方向:生物信息学,基因组变异识别,基因组拼接组装,序列比对

  • 联系方式:xzhu@ytu.edu.cn

个人简介

朱晓:男,汉族,工学博士,现为烟台大学计算机与控制学院教师。研究方向包括结构变异识别、基因组拼接组装、序列比对等。更多个人最新信息请关注: https://zhuxiao.github.io/。

教育经历

2015年7月毕业于哈尔滨工业大学计算机应用技术专业获博士学位

2008年7月毕业于哈尔滨工业大学计算机科学与技术专业获硕士学位

2006年7月毕业于河北理工大学信息与计算科学专业

主讲课程

编译原理

研究方向

生物信息学、基因组测序序列比对与拼接、基因组变异检测,欢迎感兴趣的同学联系我。

主持与参与的项目

1.国家自然科学基金青年项目,基于三代测序数据的基因组结构变异识别与评价方法研究,2020.01-2022.12,主持

2.黑龙江省自然科学基金青年项目,基于基于参考序列和多配对数据的基因组拼接错误识别方法研究,2018.07-2021.07,主持

3.黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划,三代测序数据的基因组复杂结构变异识别方法研究,2019.01-2021.12,主持

4.中央高校基本科研业务费项目,基于多配对数据的基因组拼接错误识别方法研究,2017.10-2020.09,主持

5.国家自然科学基金面上项目,基于新一代测序数据的基因组拼接组装算法研究,2012.01-2015.12,参与

6.国家自然科学基金面上项目,基于表型相似性的人类遗传疾病基因预测方法研究,2010.01-2012.12,参与

7.国家自然科学基金青年项目,基于CHIP-SEQ数据的microRNA启动子区域预测及转录因子结合位点分析,2010.01-2012.12,参与

科研成果

科研论文:

1. Yu Lei#, Yue Meng #, Xinqi Guo#, Ke Ning, Yixin Bian, Lanlan Li, Zhenduo Hu, Anastasia A. Anashkina, Qinghua Jiang*, Yucui Dong*, Xiao Zhu*. Overview of structural variation calling: Simulation, identification, and visualization. Computers in Biology and Medicine 2022, 145:105534 (IF=6.698) (*通讯作者)

2. Xuehua Zhang, Leilei Zhao, He Zhang, Yurui Zhang, Huanyu Ju, Xiaoyu Wang, Huan Ren*, Xiao Zhu*, Yucui Dong*. The immunosuppressive microenvironment and immunotherapy in human glioblastoma. Frontiers in Immunology 2022, 13:1003651 (IF=8.786) (*通讯作者)

3. Yue Meng#, Yu Lei#, Jianlong Gao#, Yuxuan Liu, Enze Ma, Yunhong Ding, Yixin Bian, Hongquan Zu, Yucui Dong*, Xiao Zhu*. Genome Sequence Assembly Algorithms and Misassembly Identification Methods. Molecular Biology Reports, 49(11):11133-11148 (IF: 2.742) (*通讯作者)

4. Xiao Zhu, Henry C.M. Leung, Rongjie Wang, FrancisY.L. Chin, Siu Ming Yiu, Guangri Quan, Yajie Li, Rui Zhang, Qinghua Jiang, Bo Liu, Yucui Dong, Guohui Zhou, Yadong Wang*. misFinder: Identify Mis-Assemblies in an Unbiased Manner Using Reference and Paired-End Reads. BMC Bioinformatics 2015, 16(1):386. (IF=2.576)

5. Xiao Zhu#, Henry C.M. Leung#, FrancisY.L. Chin, Siu Ming Yiu, Guangri Quan, Bo Liu, Yadong Wang*. PERGA: A Paired-End Read Guided De Novo Assembler for Extending Contigs Using SVM and Look Ahead Approach. PLoS ONE 2014, 9(12):e114253. (IF=3.534)

6. Xiao Zhu#, Henry C.M. Leung#, FrancisY.L. Chin, Siu Ming Yiu, Guangri Quan, Bo Liu, Yadong Wang*. PERGA: A Paired-End Read Guided De Novo Assembler for Extending Contigs Using SVM Approach. In: Proceedings of the International Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedical Informatics. Washington DC, USA: ACM; 2013: 161-170. (EI)

专利:

1. 朱晓; 雷宇; 孟悦; 边奕心; 赵松; 丁云鸿; 李玉霞. 一种基于基准集的基因组结构变异性能检测方法. 2021-6-21, 中国, ZL202111039173.0 (发明专利)


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